Gen otpornosti na karbapenem (KPC/NDM/OXA 48/OXA 23/VIM/IMP)
Naziv proizvoda
HWTS-OT045 Komplet za detekciju gena otpornosti na karbapenem (KPC/NDM/OXA 48/OXA 23/VIM/IMP) (fluorescentna PCR)
Epidemiologija
Karbapenemi su atipični β-laktamski antibiotici s najširim antibakterijskim spektrom i najjačim antibakterijskim djelovanjem. Zbog svoje stabilnosti na β-laktamaze i niske toksičnosti, postao je jedan od najvažnijih antibakterijskih lijekova za liječenje teških bakterijskih infekcija. Karbapenemi su vrlo stabilni na plazmidima posredovane β-laktamaze proširenog spektra (ESBL), kromosome i plazmidima posredovane cefalosporinaze (AmpC enzimi).
Kanal
PCR-mješavina 1 | PCR-mješavina 2 | |
FAM | IMP | VIM |
VIC/HEX | Interna kontrola | Interna kontrola |
CY5 | NDM | KPK |
ROX | OXA48
| OXA23 |
Tehnički parametri
Pohrana | ≤-18℃ |
Rok trajanja | 12 mjeseci |
Vrsta uzorka | Sputum, čiste kolonije, rektalni bris |
Ct | ≤36 |
CV | ≤5,0% |
LoD | 103CFU/mL |
Specifičnost | a) Komplet detektira standardizirane negativne reference tvrtke, a rezultati zadovoljavaju zahtjeve odgovarajućih referenci. b) Rezultati testa unakrsne reaktivnosti pokazuju da ovaj kit nema unakrsne reakcije s drugim respiratornim patogenima, kao što su Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, Staphylococcus aureus, Klebsiella oxytoca, Haemophilus influenzae, Acinetobacter junii, Acinetobacter haemolyticus, Legionella pneumophila, Escherichia coli, Pseudomonas fluorescens, Candida albicans, Chlamydia pneumoniae, respiratorni adenovirus, Enterococcus ili uzorci koji sadrže druge gene otporne na lijekove CTX, mecA, SME, SHV, TEM itd. c) Protiv interferencije: Mucin, Minociklin, Gentamicin, Klindamicin, Imipenem, Cefoperazon, Meropenem, Ciprofloksacin hidroklorid, Levofloksacin, Klavulanska kiselina, Roksitromicin odabrani su za test interferencije, a rezultati pokazuju da gore navedene tvari koje interferiraju nemaju interferirajuću reakciju na detekciju gena otpornosti na karbapenem KPC, NDM, OXA48, OXA23, VIM i IMP. |
Primjenjivi instrumenti | Applied Biosystems 7500 sustavi za PCR u stvarnom vremenu QuantStudio®5 PCR sustavi u stvarnom vremenu SLAN-96P PCR sustavi u stvarnom vremenu (Hongshi Medical Technology Co., Ltd.) LightCycler®480 sustav za PCR u stvarnom vremenu LineGene 9600 Plus sustav za detekciju PCR-a u stvarnom vremenu (FQD-96A,HangzhouBioer tehnologija) MA-6000 kvantitativni termalni cikler u stvarnom vremenu (Suzhou Molarray Co., Ltd.) BioRad CFX96 sustav za PCR u stvarnom vremenu BioRad CFX Opus 96 sustav za PCR u stvarnom vremenu |
Tijek rada
Opcija 1.
Preporučeni reagens za ekstrakciju: Macro & Micro-Test General DNA/RNA Kit (HWTS-3019-50, HWTS-3019-32, HWTS-3019-48, HWTS-3019-96) (koji se može koristiti s Macro & Micro-Test automatskim ekstraktorom nukleinskih kiselina (HWTS-3006C, HWTS-3006B)) tvrtke Jiangsu Macro & Micro-Test Med-Tech Co., Ltd.. Dodajte 200 μL fiziološke otopine u talog talusa. Sljedeći koraci trebaju slijediti upute za ekstrakciju, a preporučeni volumen eluiranja je100 μL.
Opcija 2.
Preporučeni reagens za ekstrakciju: Reagens za ekstrakciju ili pročišćavanje nukleinskih kiselina (YDP302) tvrtke Tiangen Biotech (Beijing) Co., Ltd. Ekstrakciju treba započeti strogo u skladu s 2. korakom uputa za uporabu (dodati 200 μL pufera GA u talog talusa i protresti dok se talus potpuno ne suspendira). Za eluciju koristite vodu bez RNaze/DNaze, a preporučeni volumen eluacije je 100 μL.
Opcija 3.
Preporučeni reagens za ekstrakciju: Reagens za oslobađanje uzorka za makro i mikro test. Uzorak sputuma treba isprati dodavanjem 1 mL fiziološke otopine u gore spomenuti tretirani talog talusa, centrifugirati pri 13000 o/min tijekom 5 minuta, a supernatant odbaciti (sačuvati 10-20 µL supernatanta). Za čistu koloniju i rektalni bris, dodajte 50 μL reagensa za oslobađanje uzorka izravno u gore spomenuti tretirani talog talusa, a sljedeće korake treba ekstrahirati prema uputama za uporabu.