Ljudski metilirani NDRG4/SEPT9/SFRP2/BMP3/SDC2 gen
Ime proizvoda
HWTS-OT077-Komplet za detekciju ljudskog metiliranog NDRG4/SEPT9/SFRP2/BMP3/SDC2 gena (fluorescentni PCR)
Potvrda
CE
Epidemiologija
U odraslih, više od 10 8 crijevnih epitelnih stanica svaki dan otpadne s crijevne stijenke i izluči se s izmetom kroz peristaltiku debelog crijeva.Budući da je vjerojatnije da će tumorske stanice otpasti iz probavnog trakta zbog abnormalne proliferacije, stolica pacijenata s tumorom crijeva sadrži mnoge bolesne stanice i abnormalne stanične komponente, što je materijalna osnova za otkrivanje stabilne stolice.Studije su otkrile da je modifikacija metilacije promotora gena rani događaj u nastanku tumora, a genetski materijal dobiven iz uzoraka stolice pacijenata oboljelih od raka debelog crijeva može ranije odražavati prisutnost raka u crijevima.
NDRG4, također poznat kao SMAP-8 i BDM1, jedan je od četiri člana obitelji NDRG gena (NDRG1-4), za koje se pokazalo da su povezani sa staničnom proliferacijom, diferencijacijom, razvojem i stresom.Potvrđeno je da je metilacija NDRG4 potencijalni biomarker za neinvazivno otkrivanje kolorektalnog karcinoma u uzorcima stolice.
SEPT9 je član obitelji gena Septin, koja se sastoji od najmanje 13 gena koji kodiraju očuvanu GTPase domenu koja može vezati proteine povezane s citoskeletom, a povezana je sa staničnom diobom i tumorigenezom.Studije su otkrile da je sadržaj metiliranog gena Septin9 karakteristično povećan u uzorcima stolice pacijenata s kolorektalnim rakom.
Izlučeni frizzled-related proteini (sFRPs) su topljivi proteini koji su klasa antagonista Wnt puta zbog njihove visoke strukturne homologije s frizzled (Fz) receptorom za Wnt signalizaciju.Inaktivacija SFRP gena rezultira nekontroliranom aktivacijom Wnt signalizacije povezane s kolorektalnim rakom.Trenutno se metilacija SFRP2 u stolici može koristiti kao neinvazivni biomarker za dijagnozu kolorektalnog karcinoma.
BMP3 je član superobitelji TGF-B i stoga igra važnu ulogu u embrionalnom razvoju inducirajući i oblikujući rano stvaranje kostiju.BMP3 je hipermetiliran u kolorektalnom karcinomu i može se koristiti kao važan tumorski marker.
SDC2 je površinski heparan sulfat proteoglikan uključen u regulaciju mnogih fizioloških i patoloških procesa.Fizička obrada uključuje staničnu proliferaciju, diferencijaciju, adheziju, citoskeletnu organizaciju, migraciju, zacjeljivanje rana, komunikaciju stanica-matriks, angiogenezu;Patološki procesi uključuju upalu i rak.Razina metilacije gena SDC2 u tkivima raka debelog crijeva bila je znatno viša nego u normalnim tkivima.
Kanal
Reakcijski pufer A | VIC/HEX | metilirani NDRG4 gen |
ROX | metilirani SEPT9 gen | |
CY5 | unutarnja kontrola | |
Reakcijski pufer B | VIC/HEX | metilirani SFRP2 gen |
ROX | metilirani BMP3 gen | |
FAM | metilirani gen SDC2 | |
CY5 | unutarnja kontrola |
Tumačenje
Gen | Kanal signala | Ct vrijednost | Tumačenje |
NDRG4 | VIC (HEX) | Ct vrijednost≤38 | NDRG4 pozitivan |
Ct vrijednost>38 ili manje | NDRG4 negativan | ||
RUJNA9 | ROX | Ct vrijednost≤38 | SEPT9 pozitivno |
Ct vrijednost>38 ili manje | SEPT9 negativno | ||
SFRP2 | VIC (HEX) | Ct vrijednost≤38 | SFRP2 pozitivan |
Ct vrijednost>38 ili manje | SFRP2 negativan |
Tehnički parametri
Skladištenje | Tekućina: ≤-18℃ |
Rok trajanja | 9 mjeseci |
Vrsta uzorka | Uzorak stolice |
CV | ≤5,0% |
Specifičnost | Ne postoji unakrsna reakcija s rakom jetre, rakom žučnih vodova, rakom štitnjače i rakom pluća |
Primjenjivi instrumenti | QuantStudio ®5 PCR sustavi u stvarnom vremenu SLAN-96P PCR sustavi u stvarnom vremenu LightCycler®480 Real-Time PCR sustav LineGene 9600 Plus PCR sustav detekcije u stvarnom vremenu MA-6000 Kvantitativni termalni cikler u stvarnom vremenu |
Tijek rada
Preporučeni reagens za ekstrakciju: Macro & Micro-Test Viral DNA/RNA Kit (HWTS-3001, HWTS-3004-32, HWTS-3004-48, HWTS-3004-96) i Macro & Micro-Test Automatic Nucleic Acid Extractor (HWTS- 3006).