Nedavna metagenomska studija otkrila je izuzetno raznolik spektar virusa i bakterija koje prenose glodavci u provinciji Heilongjiang, uključujući virus Lassa, virus Amur, Salmonelu i Yersinia pestis.
U istraživanju je korištenoKomplet za obogaćivanje patogene RNA tvrtke Macro & Micro-Test, temeljeno na tehnologiji hvatanja sonde. Selektivnim uklanjanjem rRNA domaćina i drugih konzerviranih fragmenata domaćina, metoda je učinkovito zadržala mikrobnu RNA, značajno poboljšavajući osjetljivost detekcije patogena. Ovaj korak obogaćivanja patogene RNA bio je ključan za postizanje visoke stope detekcije i pružio je snažnu tehničku podršku za nadzor patogena.
Glodavci: ključni rezervoari zoonotskih bolesti
Glodavci su vrstama najbogatija i široko rasprostranjena skupina sisavaca, koja obuhvaća više od 2000 vrsta diljem svijeta i čini preko 40% svih vrsta sisavaca.
Osim ekološke važnosti, glodavci služe kao glavni rezervoari i vektori brojnih zoonotskih patogena.Budući da se staništa glodavaca često preklapaju s ljudskim okruženjem - izravnim ugrizima, kontaktom s izmetom ili neizravnim prijenosom putem buha i grinja - patogeni koje sadrže predstavljaju trajnu prijetnju javnom zdravlju.
Značajno je da više od 70% novih zaraznih bolesti potječe od divljih životinja, a glodavci predstavljaju jedan od najznačajnijih rezervoara virusa.
Pogranična regija Heilongjiang: Prva crta za nadzor patogena
Heilongjiang, pogranična pokrajina na sjeveroistoku Kine, posjeduje obilne ekološke resurse i graniči s više zemalja. Kombinacija bogate bioraznolikosti i čestog prekograničnog kretanja stanovništva stvara povoljne uvjete za prijenos patogena.
Između lipnja i srpnja 2021. istraživači su prikupili 67 divljih glodavaca iz grada Hengdaohezi u gradu Mudanjiang. Uzorci su uključivali:
20. godinaPoluotok Apodemus
l 47Myodes rufocanus
Svi primjerci su uhvaćeni u stambenim područjima i okolnim poljoprivrednim zemljištima, što naglašava blisku povezanost ljudskih naselja i staništa divljih životinja.
Tehnologija obogaćivanja patogena: Prevladavanje pozadinskih smetnji domaćina
U metagenomskom sekvenciranju, RNK domaćina obično dominira očitanjima sekvenciranja, maskirajući signale patogena male količine.
Kako bi se riješio ovaj izazov, u studiji se koristiloKomplet za detekciju metagenomskih patogena tvrtke Macro & Micro-Test. Korištenjem tehnologije hvatanja sondi, posebno dizajnirane sonde vežu se na rRNA domaćina i konzervirane sekvence, omogućujući njihovo iscrpljivanje i time obogaćujući mikrobnu RNA.
Ovaj pristup znatno je poboljšao osjetljivost detekcije patogena, omogućujući sekvenciranje nakon sekvenciranja kako bi se dobio veći udio očitanja patogena. Korak obogaćivanja postavio je čvrste temelje za točnu karakterizaciju spektra patogena koje prenose glodavci.
Nakon obogaćivanja, uzorci RNA podvrgnuti su reverznoj transkripciji, konstrukciji biblioteke i visokopropusnom sekvenciranju. Bioinformatička analiza uključivala je:
Filtriranje genoma domaćina
Taksonomska klasifikacija pomoću Kraken2
Korekcija obilja s Brackenom
Ovaj tijek rada generirao je sveobuhvatan profil virusnih i bakterijskih zajednica.
Rezultati istraživanja: Kocirkulacija više virusa i bakterija
Virusni nalazi
Detektovani virusi pripadali su 21 virusnoj porodici, uključujućiArenaviridaeiHantaviridae.
Krozde novosastavljanjem pomoću Megahita, generirano je 154 virusna kontiga, od kojih se 110 poravnalo s 19 virusa iz osam porodica.
In Poluotok Apodemus, identificirani su sljedeći virusi:
l Arenavirusi: Lassa virus, Wenzhou virus, Gairo virus
l Hantavirusi: Amur virus, Puumala virus
In Myodes rufocanus, Otkriveni su štakorski arterivirus i Amur virus.
Među tim patogenima:
Virus Lassa je uzročnik virusne hemoragijske groznice, a stopa smrtnosti doseže približno 20%.
l Amur virus je jedan od patogena odgovornih za hemoragijsku groznicu s bubrežnim sindromom (HFRS). Kina bilježi najveći globalni teret infekcija hantavirusom.
Bakterijski nalazi
Ukupno je označeno 1051 bakterijskih rodova.
Najbrojniji rodovi bili su:
lSalmonela(26–31%)
lJersinija(11–23%)
Salmonelaje glavni patogen koji se prenosi hranom, odgovoran za otprilike 9 milijuna slučajeva tifusa i otprilike 110 000 smrtnih slučajeva godišnje diljem svijeta.
Yersinia pestis, uzročnik kuge, odgovoran je za tri povijesne pandemije. Provincija Heilongjiang prepoznata je kao jedno od prirodnih žarišta kuge u Kini i ostaje prioritetna regija za nadzor kuge.
Značaj studije
Znanstveni doprinosi
Ova studija predstavlja prvo izvješće o fragmentima virusa Lassa i virusu arteritisa štakora kod glodavaca iz Heilongjianga, proširujući kinesku bazu podataka patogena koje prenose glodavci.
Sustavno karakterizira virusne i bakterijske zajednice u lokalnim populacijama glodavaca, pružajući osnovne podatke za nadzor zoonoza u pograničnim regijama.
Implikacije za javno zdravlje
Nalazi naglašavaju potrebu za kontinuiranim nadzorom i probirom patogenaA. peninsulaeiM. rufocanus.
Podaci pružaju znanstvene dokaze koji podupiru strategije kontrole izvora za bolesti poput kuge i hemoragijske groznice s bubrežnim sindromom.
Metodološke prednosti
Metagenomsko sekvenciranje omogućuje nepristrano otkrivanje poznatih i novih patogena.
U ovoj studiji, Macro & Micro-Testova tehnologija obogaćivanja patogena pokazala je snažne performanse, učinkovito poboljšavajući detekciju ciljnih patogena u složenim biološkim uzorcima. Rezultati potvrđuju njezinu sposobnost podrške visokoosjetljivoj identifikaciji patogena u nadzoru divljih životinja.
Preporuka proizvoda
Na temelju uspješne primjene u ovoj studiji, komplet za obogaćivanje makro i mikrotestne patogenske RNA toplo se preporučuje za istraživanja metagenomskog nadzora.
Učinkovitim smanjenjem nukleinskih kiselina domaćina i obogaćivanjem mikrobnih sekvenci, komplet značajno poboljšava osjetljivost detekcije i kvalitetu podataka. Predstavlja bitan alat za točno otkrivanje patogena u složenim uzorcima i pruža snažnu tehničku podršku za nadzor javnog zdravstva, procjenu rizika od zoonoza i pripravnost za izbijanje epidemija.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Vrijeme objave: 02.03.2026.