Nedavno,Tjednik CDC-a u Kiniobjavio je važan istraživački članak koji opisuje epidemiološko i etiološko istraživanje akutne epidemije gastroenteritisa uzrokovane rotavirusom skupine C (RVC) u osnovnoj školi u Luzhouu, provincija Sečuan, u listopadu 2025. Značajno je da su Macro & Micro-Testov visokoučinkoviti ciljani komplet za hvatanje patogena (hvatanje sondom) i tehnologija sekvenciranja obogaćivanja cijelog genoma odigrali ključnu ulogu u istraživanju. Omogućavajući točnu identifikaciju patogena i sveobuhvatnu genomsku karakterizaciju, tehnologija je pružila ključne znanstvene dokaze za brzu potvrdu epidemije, precizno praćenje izvora i učinkovitu kontrolu epidemije.
Iznenadna epidemija: Prva prijavljena epidemija RVC-a u jugozapadnoj Kini
Dana 15. listopada 2025. u osnovnoj školi u Luzhouu došlo je do izbijanja akutnog gastroenteritisa. Škola je imala ukupno 1943 učenika i osoblja, s prijavljenih 32 slučaja, uključujući 6 laboratorijski potvrđenih i 26 klinički dijagnosticiranih slučajeva, što je rezultiralo ukupnom stopom oboljenja od 1,65%. Izbijanje je doseglo vrhunac između 15. i 16. listopada, s najvećom stopom oboljenja (23,08%) u 7. i 5. razredu (23,08%). Većina pacijenata bila su djeca školske dobi (srednja dob: 10 godina), a prvenstveno su se prezentirali s povraćanjem (65,62%), proljevom (46,87%) i bolovima u trbuhu (37,50%). Simptomi su obično trajali 1-3 dana, a svi pacijenti su se oporavili bez teških komplikacija.
Epidemiološka istraga identificirala je indeksni slučaj kao 11-godišnjeg dječaka u 7. razredu, 5. razredu. Njegova mlađa sestra razvila je slične simptome prije njega, što upućuje na kućni prijenos kao početni izvor. Neadekvatno zbrinjavanje povraćenog otpada na kampusu - uključujući izravno metenje i odlaganje bez pravovremene dezinfekcije ili izolacije područja - u kombinaciji s lošom higijenom ruku među učenicima vjerojatno je olakšalo daljnji prijenos. Većina pogođenih učionica nalazila se između drugog i petog kata i dijelila je susjedne muške toalete, što ukazuje na to da su i aerosolni i kontaktni prijenos mogli doprinijeti širenju.
Istraga je postala posebno izazovna jer su rutinski testovi na patogene, uključujući testove na norovirus i rotavirus grupe A, dali negativne rezultate, što ukazuje na to da je odgovoran neuobičajeni patogen.
Etiološka dijagnoza: Sekvenciranje cijelog genoma makro i mikro testom identificira krivca
Početno testiranje na norovirus bilo je negativno. CDC u Luzhouu naknadno je upotrijebio multipleks PCR test u stvarnom vremenu za gastrointestinalne patogene, sposoban istovremeno detektirati 28 patogena, uključujući 8 virusa, 17 bakterija i 3 parazita, kako bi procijenio osam kliničkih uzoraka. Dana 17. listopada šest uzoraka bilo je pozitivno na rotavirus skupine C, čime je uspješno identificiran uzročni patogen.
Kako bi dodatno pratili izvor epidemije, istraživači su proveli i nanopore metagenomsko sekvenciranje i Macro & Micro-Testovo sekvenciranje obogaćivanja cijelog genoma hvatanjem sonde na pet pozitivnih uzoraka. Ovim pristupom uspješno je generirano pet kompletnih RVC genomskih sekvenci (SC01–SC05). Integrirana strategija brzog multipleks PCR probira, nakon čega slijedi sekvenciranje cijelog genoma visoke rezolucije, pružila je snažnu tehničku podršku za točnu molekularnu epidemiologiju i praćenje izvora.
Znanstveni uvidi: Prva identifikacija genotipa M2 u jugozapadnoj Kini
Na temelju visokokvalitetnih podataka o cijelom genomu generiranih korištenjem Macro & Micro-Test tehnologije, istraživački tim izvijestio je o nekoliko važnih znanstvenih otkrića:
Potvrda monoklonske epidemije:Svih pet virusnih izolata dijelilo je identičan genotip cijelog genoma (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), sa samo 0-1 razlikama u polimorfizmu jednog nukleotida (SNP), što konačno pokazuje da je epidemija nastala iz jednog lanca prijenosa.
Otkriće genotipa M2:Filogenetska analiza otkrila je da sojevi Luzhou RVC pripadaju genotipu M2, a ne genotipu M3 koji se prethodno smatrao dominantnim među kineskim sojevima RVC. Ovo otkriće dovodi u pitanje konvencionalno razumijevanje distribucije genotipa RVC u Kini i potvrđuje pojavu genotipa M2 u jugozapadnoj Kini.
Dokazi o međunarodnim prijenosnim vezama:Usporedba cijelog genoma pokazala je visoku genetsku sličnost između sojeva Luzhou i sojeva RVC prethodno opisanih u Yunnanu (2025.), Novosibirsku u Rusiji (2017.) i Italiji (2012.), što sugerira postojanje aktivne euroazijske prijenosne mreže.
Implikacije za prevenciju i kontrolu: Rano otkrivanje i brza intervencija su ključni
Nakon identifikacije patogena, CDC Luzhou odmah je proveo sveobuhvatne mjere kontrole, uključujući izolaciju slučajeva, dezinfekciju okoliša, standardizirano upravljanje povraćenim sadržajem i privremenu obustavu nastave. Pojava je uspješno suzbijena unutar jednog inkubacijskog razdoblja, bez prijavljenih dodatnih slučajeva nakon 21. listopada.
Istraživanje također pruža važnu lekciju za javno zdravstvo: za klasterirane epidemije gastroenteritisa koje su negativne i na rotavirus skupine A i na norovirus, rotavirus skupine C i druge rotaviruse koji nisu iz skupine A treba uključiti u rutinske dijagnostičke probire.
Ova studija predstavlja prvu prijavljenu epidemiju rotavirusa skupine C u jugozapadnoj Kini i prvu identifikaciju genotipa M2 u regiji, proširujući trenutno razumijevanje epidemiologije rotavirusa u istočnoj Aziji. U ovom istraživanju, integrirano rješenje tvrtke Macro & Micro-Test koje kombinira multipleks PCR probir sa sekvenciranjem obogaćivanja cijelog genoma pokazalo je značajnu praktičnu vrijednost omogućujući brzu identifikaciju patogena i molekularno praćenje izvora visoke rezolucije, pružajući ponovljiv tehnički okvir za precizno istraživanje i kontrolu budućih epidemija zaraznih bolesti.
Vrijeme objave: 30. srpnja 2026.